水浴恒温振荡器按振荡方式可分往复式，回旋式及双功能三种方式，按控温范围可分为常温型和全温型。
1、往复式水浴振荡器具有较大的通气量，能在较短时间内获得理想的培养效果或混匀效果，而其在高速振荡时，瓶内的溶液容易从瓶口溢出，所以在使用高速振荡时应在瓶口加盖聚四氟乙烯瓶塞。
2、回旋式水浴振荡器在高速振荡时瓶内液体不会溢出，但通气量没有往复式大，同时振荡效果没有往复式明显，一般在做微生物培养时多选择此类振荡方式。
3、双功能水浴振荡器可根据使用要求选择不同的振荡方式，可以一机两用。
4、常温型水浴振荡器是指控温范围在室温-100℃之间，其控温范围随着环境温度变化而变化，一旦使用温度超过低于环境温度时，将无法工作，出现此种情况，应选择全温型水浴恒温振荡器。
5、全温型水浴振荡器是指控温范围在0-100℃之间，其工作温度不受环境温度影响。